Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1orf54Q8WWF1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf54Q8WWF1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf54Q8WWF1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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