Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM4Q8NFZ8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CADM4Q8NFZ8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms