Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CARMIL3Q8ND23 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CARMIL3Q8ND23 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CARMIL3Q8ND23 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms