Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAAF3Q8N9W5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms