Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPM1NQ8N819 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPM1NQ8N819 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms