Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SVBPQ8N300 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SVBPQ8N300 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms