Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YTHDF3Q7Z739 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 448.6 ms