Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LPCAT2Q7L5N7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LPCAT2Q7L5N7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPCAT2Q7L5N7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms