Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IKBIPQ70UQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IKBIPQ70UQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms