Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RSPH4AQ5TD94 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RSPH4AQ5TD94 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RSPH4AQ5TD94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms