Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LDLRAD1Q5T700 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LDLRAD1Q5T700 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LDLRAD1Q5T700 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms