Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDK2Q58EX2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDK2Q58EX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms