Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGO2Q562F6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGO2Q562F6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGO2Q562F6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms