Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HS1BP3Q53T59 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HS1BP3Q53T59 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms