Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP39Q53GS9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP39Q53GS9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP39Q53GS9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms