Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM74A3Q4VXF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM74A3Q4VXF1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms