Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00303Q3SY05 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00303Q3SY05 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms