Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL38Q2WGJ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms