Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM71Q2Q1W2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM71Q2Q1W2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms