Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SWI5Q1ZZU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SWI5Q1ZZU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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