Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL23Q16540 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MRPL23Q16540 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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