Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
VPS72Q15906 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
VPS72Q15906 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
VPS72Q15906 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
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