Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SHPRHQ149N8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SHPRHQ149N8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
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