Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX6Q13608 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX6Q13608 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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