Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MKRN3Q13064 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MKRN3Q13064 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms