Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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GTF3C1Q12789 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C1Q12789 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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GTF3C1Q12789 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C1Q12789 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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GTF3C1Q12789 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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GTF3C1Q12789 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GTF3C1Q12789 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C1Q12789 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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