Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YOS9YDR057W 1629 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 SPC19YDR201W 498 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 GTT1YIR038C 705 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 PDR15YDR406W 4590 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 FOB1YDR110W 1701 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 EAR1YMR171C 1653 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 MKK2YPL140C 1521 nt6.19□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 HNT2YDR305C 654 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 BRE4YDL231C 3378 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 RCM1YNL022C 1473 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 MNT2YGL257C 1677 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 KIN3YAR018C 1308 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 AAD3YCR107W 1092 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 BSC1YDL037C 987 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 RAD14YMR201C 1116 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 RDL1YOR285W 420 nt6.18□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 LRG1YDL240W 3054 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 YEL020CYEL020C 1683 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 YIL171WYIL171W 330 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 KTR2YKR061W 1278 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 YJL206CYJL206C 2277 nt6.17□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 YPL077CYPL077C 723 nt6.16□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 PAH1YMR165C 2589 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 JEN1YKL217W 1851 nt6.15□□□□□ -1.42
TY1B-BRQ12193 GIP2YER054C 1647 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 ERP2YAL007C 648 nt6.15□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 CRT10YOL063C 2874 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 SOD1YJR104C 465 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 IMA1YGR287C 1770 nt6.14□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 YGR017WYGR017W 894 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 PAL1YDR348C 1500 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 snR7-SsnR7-S 179 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 APA2YDR530C 978 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 YGL185CYGL185C 1140 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 RPS19AYOL121C 435 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 YKR104WYKR104W 921 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 YSF3YNL138W-A 258 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 YER077CYER077C 2067 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 RPL24AYGL031C 468 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 SUI1YNL244C 327 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 snR17bsnR17b 332 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 PUB1YNL016W 1362 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 PBS2YJL128C 2007 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1B-BRQ12193 RPO31YOR116C 4383 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 TVP38YKR088C 1014 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 YBR225WYBR225W 2703 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 EUG1YDR518W 1554 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 GDA1YEL042W 1557 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 YMR084WYMR084W 789 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 BUB3YOR026W 1026 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 SUA7YPR086W 1038 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 MPS3YJL019W 2049 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 PCL10YGL134W 1302 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 HIS5YIL116W 1158 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 YJL193WYJL193W 1209 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 VPS53YJL029C 2469 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 GUP2YPL189W 1830 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 HSP150YJL159W 1242 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 AAD10YJR155W 867 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 TDA8YAL064C-A 381 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 SSU1YPL092W 1377 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 PFK1YGR240C 2964 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 PIR3YKL163W 978 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 RPL19BYBL027W 570 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 ASC1YMR116C 960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 SSM4YIL030C 3960 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 DBP9YLR276C 1785 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 LSG1YGL099W 1923 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 KRE6YPR159W 2163 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 BBC1YJL020C 3474 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 MRH4YGL064C 1686 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 THI13YDL244W 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 THI11YJR156C 1023 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 GLO4YOR040W 858 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 OPY1YBR129C 987 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 YGR018CYGR018C 330 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 FHL1YPR104C 2811 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 LHP1YDL051W 828 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1B-BRQ12193 UBA1YKL210W 3075 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 HEM15YOR176W 1182 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 MRP51YPL118W 1035 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 PMA1YGL008C 2757 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YIR007WYIR007W 2295 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 MTC3YGL226W 372 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 PLP2YOR281C 861 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 MET4YNL103W 2019 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 HST1YOL068C 1512 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 ROD1YOR018W 2514 nt6□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 AXL2YIL140W 2472 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YEN1YER041W 2280 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 ELO2YCR034W 1044 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 FOL2YGR267C 732 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YDR250CYDR250C 276 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YIL077CYIL077C 963 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 MMT1YMR177W 1533 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 MAG1YER142C 891 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 AIR1YIL079C 1083 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 ISA1YLL027W 753 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 GAS3YMR215W 1575 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1B-BRQ12193 YPR022CYPR022C 3402 nt5.97□□□□□ -1.45
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