Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSRP1Q08945 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSRP1Q08945 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSRP1Q08945 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms