Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 LYS5YGL154C 819 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 COX18YGR062C 951 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 GRE3YHR104W 984 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 GPP1YIL053W 753 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 TEF4YKL081W 1239 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 SPC34YKR037C 888 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YKR075CYKR075C 924 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 DSE3YOR264W 1293 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPL071CYPL071C 471 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPR071WYPR071W 636 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 SAP4YGL229C 2457 nt3.31□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 GAD1YMR250W 1758 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 PGM2YMR105C 1710 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 SET4YJL105W 1683 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 MAL13YGR288W 1422 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 RPN6YDL097C 1305 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YDR445CYDR445C 408 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YGL262WYGL262W 528 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YJL215CYJL215C 360 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 NTR2YKR022C 969 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YAR061WYAR061W 204 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YNL217WYNL217W 981 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 PDR15YDR406W 4590 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 ARN2YHL047C 1863 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 RCK2YLR248W 1833 nt3.3□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 EUG1YDR518W 1554 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 MCM4YPR019W 2802 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 RAD28YDR030C 1521 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 TUP1YCR084C 2142 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 LUC7YDL087C 786 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 SNA2YDR525W-A 240 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YER190C-BYER190C-B 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YFL068WYFL068W 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 PXR1YGR280C 816 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 CSR1YLR380W 1227 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YML133W-BYML133W-B 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 RMI1YPL024W 726 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 NRG2YBR066C 663 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 SSH4YKL124W 1740 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 VPS36YLR417W 1701 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 TAF5YBR198C 2397 nt3.29□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 OMS1YDR316W 1416 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 TIP20YGL145W 2106 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 HXT7YDR342C 1713 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 HXT6YDR343C 1713 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 DPH6YLR143W 2058 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 TAF10YDR167W 621 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 ARG82YDR173C 1068 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 NAT2YGR147C 867 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YKL169CYKL169C 384 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 ROT1YMR200W 771 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 COG5YNL051W 1212 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YNL143CYNL143C 393 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YNG1YOR064C 660 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPL073CYPL073C 486 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 YPL278CYPL278C 303 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 NMD3YHR170W 1557 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 LYP1YNL268W 1836 nt3.28□□□□□ -1.88
RDS3Q06835 PEP5YMR231W 3090 nt3.28□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 CYM1YDR430C 2970 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 BNA6YFR047C 888 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 RMR1YGL250W 726 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 YGR122WYGR122W 1209 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 YIL165CYIL165C 360 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 COA3YJL062W-A 258 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 RFC2YJR068W 1062 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 YLR124WYLR124W 345 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 NMD4YLR363C 657 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 NAT5YOR253W 531 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 APC1YNL172W 5247 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 FKH1YIL131C 1455 nt3.27□□□□□ -1.89
RDS3Q06835 YER158CYER158C 1722 nt3.27□□□□□ -1.89
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