Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YGR016W	YGR016W	573 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	DCD1	YHR144C	939 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	UBI4	YLL039C	1146 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	CSR1	YLR380W	1227 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	DSE3	YOR264W	1293 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	KGD1	YIL125W	3045 nt		5.24	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ALG6	YOR002W	1635 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ARP10	YDR106W	855 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	FMP48	YGR052W	1110 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YNK1	YKL067W	462 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	ICY2	YPL250C	411 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	YPR071W	YPR071W	636 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	GAD1	YMR250W	1758 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MAD3	YJL013C	1548 nt		5.23	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	GSH2	YOL049W	1476 nt		5.22	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	TSL1	YML100W	3297 nt		5.22	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	LYS5	YGL154C	819 nt		5.22	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	RCK2	YLR248W	1833 nt		5.22	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	MKS1	YNL076W	1755 nt		5.21	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	SAP4	YGL229C	2457 nt		5.21	□□□□□ -1.57
MRD1	Q06106	PDR15	YDR406W	4590 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	BLM10	YFL007W	6432 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YGR011W	YGR011W	327 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YNL217W	YNL217W	981 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YPL113C	YPL113C	1191 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MSE1	YOL033W	1611 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	KRS1	YDR037W	1776 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YJL206C	YJL206C	2277 nt		5.21	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	CLF1	YLR117C	2064 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	SSH4	YKL124W	1740 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	CPR4	YCR069W	957 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	SNA2	YDR525W-A	240 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	COX18	YGR062C	951 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YBL029W	YBL029W	1131 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	NOP13	YNL175C	1212 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MRP21	YBL090W	534 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	CAF4	YKR036C	1932 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	TDA7	YNL176C	1911 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	CRT10	YOL063C	2874 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	RTC1	YOL138C	4026 nt		5.2	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	DPH6	YLR143W	2058 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	DHH1	YDL160C	1521 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	CBP1	YJL209W	1965 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MCM4	YPR019W	2802 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	ARG82	YDR173C	1068 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YHR214W	YHR214W	612 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YAR066W	YAR066W	612 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	AXL2	YIL140W	2472 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	TAF5	YBR198C	2397 nt		5.19	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	UBP7	YIL156W	3216 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	ABF1	YKL112W	2196 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YER134C	YER134C	537 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YIL165C	YIL165C	360 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	NMD4	YLR363C	657 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YMR086C-A	YMR086C-A	339 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	SPS18	YNL204C	903 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	TGS1	YPL157W	948 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	RPN6	YDL097C	1305 nt		5.18	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	NMD3	YHR170W	1557 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	TPS3	YMR261C	3165 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YHR212W-A	YHR212W-A	204 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	COA3	YJL062W-A	258 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YKR075C	YKR075C	924 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YAR061W	YAR061W	204 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YPL278C	YPL278C	303 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	ARR1	YPR199C	885 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	FRE1	YLR214W	2061 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	PCL10	YGL134W	1302 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	RAD28	YDR030C	1521 nt		5.17	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	HER2	YMR293C	1395 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	SUR2	YDR297W	1050 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YGR266W	YGR266W	2106 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	PXR1	YGR280C	816 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MAD2	YJL030W	591 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	YNG1	YOR064C	660 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	NAT5	YOR253W	531 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MST1	YKL194C	1389 nt		5.16	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	LEU1	YGL009C	2340 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	SVF1	YDR346C	1446 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MNT2	YGL257C	1677 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	VHC1	YBR235W	3363 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	IXR1	YKL032C	1794 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	MET3	YJR010W	1536 nt		5.15	□□□□□ -1.58
MRD1	Q06106	TAF10	YDR167W	621 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	SPO74	YGL170C	1242 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	RFC2	YJR068W	1062 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	ECM1	YAL059W	639 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	UIP3	YAR027W	708 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	CDC21	YOR074C	915 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	LYP1	YNL268W	1836 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	KRE6	YPR159W	2163 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	CTF18	YMR078C	2226 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	SIS2	YKR072C	1689 nt		5.15	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	INO2	YDR123C	915 nt		5.14	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	FMP33	YJL161W	543 nt		5.14	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	YKL169C	YKL169C	384 nt		5.14	□□□□□ -1.59
MRD1	Q06106	YBL081W	YBL081W	1107 nt		5.14	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms