Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT17Q04695 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT17Q04695 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms