Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ATP7AQ04656 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP7AQ04656 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP7AQ04656 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms