Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	NTR2	YKR022C	969 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	ROT1	YMR200W	771 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	AFT1	YGL071W	2073 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	NGL2	YMR285C	1548 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SYP1	YCR030C	2613 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YHR214W	YHR214W	612 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YAR066W	YAR066W	612 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YHR177W	YHR177W	1362 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	UGA1	YGR019W	1416 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	BUD8	YLR353W	1812 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	UBA2	YDR390C	1911 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	TIP20	YGL145W	2106 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	PCT1	YGR202C	1275 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YBL029W	YBL029W	1131 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	DCS2	YOR173W	1062 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	HMT1	YBR034C	1047 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YPR109W	YPR109W	885 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	OMS1	YDR316W	1416 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	DNF2	YDR093W	4839 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	RIM15	YFL033C	5313 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	KGD1	YIL125W	3045 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YIL165C	YIL165C	360 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	ARR1	YPR199C	885 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SPO77	YLR341W	1434 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	MGS1	YNL218W	1764 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	UBP9	YER098W	2265 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	LUC7	YDL087C	786 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	INO2	YDR123C	915 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	COA3	YJL062W-A	258 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	GSP2	YOR185C	663 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YOR289W	YOR289W	756 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	DHH1	YDL160C	1521 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	DPB4	YDR121W	591 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YDR445C	YDR445C	408 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SNA2	YDR525W-A	240 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	PIC2	YER053C	903 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SUT1	YGL162W	900 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	GRE3	YHR104W	984 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	SRN2	YLR119W	642 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	YLR346C	YLR346C	306 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	MET12	YPL023C	1974 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SYF1	Q04048	APL6	YGR261C	2430 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RTC5	YOR118W	1704 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	SAP155	YFR040W	3009 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	SNF3	YDL194W	2655 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YFT2	YDR319C	825 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	ADE6	YGR061C	4077 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	NMD3	YHR170W	1557 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	MAL13	YGR288W	1422 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	SSB2	YNL209W	1842 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	HXT7	YDR342C	1713 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	HXT6	YDR343C	1713 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	MMS21	YEL019C	804 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YGL152C	YGL152C	678 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	FRA2	YGL220W	363 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	MAK3	YPR051W	531 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RVB1	YDR190C	1392 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YDL183C	YDL183C	963 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	ARG82	YDR173C	1068 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RPL28	YGL103W	450 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	DCD1	YHR144C	939 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RPS4B	YHR203C	786 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RPS4A	YJR145C	786 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	DSC2	YOL073C	969 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RKM4	YDR257C	1485 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	AAD4	YDL243C	990 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YEL067C	YEL067C	588 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YNL143C	YNL143C	393 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	NRG2	YBR066C	663 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	SET4	YJL105W	1683 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	NOC4	YPR144C	1659 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YTA6	YPL074W	2265 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	MNN4	YKL201C	3537 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	PCL10	YGL134W	1302 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	LDB17	YDL146W	1476 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	TMA17	YDL110C	453 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	GRX4	YER174C	735 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	MRM2	YGL136C	963 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YGL262W	YGL262W	528 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	CNB1	YKL190W	528 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	REG2	YBR050C	1017 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RCK2	YLR248W	1833 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	FRS1	YLR060W	1788 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	APC1	YNL172W	5247 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YGL185C	YGL185C	1140 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	RPS0B	YLR048W	759 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	SUM1	YDR310C	3189 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	YBR139W	YBR139W	1527 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SYF1	Q04048	KRS1	YDR037W	1776 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	SUL2	YLR092W	2682 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	YJL215C	YJL215C	360 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SYF1	Q04048	VPS36	YLR417W	1701 nt		5.27	□□□□□ -1.57

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