Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CENPCQ03188 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CENPCQ03188 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms