Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
XPCQ01831 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms