Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
XPCQ01831 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
XPCQ01831 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
XPCQ01831 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
XPCQ01831 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
XPCQ01831 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
XPCQ01831 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
XPCQ01831 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
XPCQ01831 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
XPCQ01831 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
XPCQ01831 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
XPCQ01831 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms