Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
KRTAP12-1P59990 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms