Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB1P54762 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHB1P54762 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms