Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EPHB3P54753 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EPHB3P54753 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EPHB3P54753 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms