Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMTNP53814 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMTNP53814 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMTNP53814 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMTNP53814 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMTNP53814 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMTNP53814 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMTNP53814 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMTNP53814 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMTNP53814 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNP53814 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNP53814 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMTNP53814 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMTNP53814 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms