Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 STP4YDL048C 1473 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 NOP58YOR310C 1536 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YHR140WYHR140W 720 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ECM15YBL001C 315 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 BUD17YNR027W 954 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 MED4YOR174W 855 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ESF1YDR365C 1887 nt4.13□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YBR139WYBR139W 1527 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 CNL1YDR357C 369 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 NAT2YGR147C 867 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YLF2YHL014C 1218 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 CIA2YHR122W 696 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ATG33YLR356W 594 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 GTR1YML121W 933 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YBR016WYBR016W 387 nt4.12□□□□□ -1.75
SYF2P53277 OLE1YGL055W 1533 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YNL134CYNL134C 1131 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 RFA2YNL312W 822 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YOR292CYOR292C 930 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 SNF2YOR290C 5112 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ISR1YPR106W 1332 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 MOT2YER068W 1764 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 MKS1YNL076W 1755 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ALD3YMR169C 1521 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ALD2YMR170C 1521 nt4.11□□□□□ -1.75
SYF2P53277 GRC3YLL035W 1899 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 CDC10YCR002C 969 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YIL028WYIL028W 399 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YNL194CYNL194C 906 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 CIN5YOR028C 888 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 REI1YBR267W 1182 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 MET4YNL103W 2019 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 NUP2YLR335W 2163 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 NUP116YMR047C 3342 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 CTT1YGR088W 1689 nt4.1□□□□□ -1.75
SYF2P53277 PRP28YDR243C 1767 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 TFG1YGR186W 2208 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 RTT103YDR289C 1230 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YGR016WYGR016W 573 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YHR214WYHR214W 612 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YAR066WYAR066W 612 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ROT1YMR200W 771 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 ELC1YPL046C 300 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 FDC1YDR539W 1512 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 YMR221CYMR221C 1515 nt4.09□□□□□ -1.75
SYF2P53277 STR2YJR130C 1920 nt4.09□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PER1YCR044C 1074 nt4.08□□□□□ -1.76
SYF2P53277 OCA4YCR095C 1089 nt4.08□□□□□ -1.76
SYF2P53277 SLD2YKL108W 1362 nt4.08□□□□□ -1.76
SYF2P53277 MSE1YOL033W 1611 nt4.08□□□□□ -1.76
SYF2P53277 HOYDL227C 1761 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YEH2YLR020C 1617 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ALG2YGL065C 1512 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RPG1YBR079C 2895 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 NNK1YKL171W 2787 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 UPC2YDR213W 2742 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 CPR4YCR069W 957 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 SUR2YDR297W 1050 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ACT1YFL039C 1128 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YIL165CYIL165C 360 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 GPI12YMR281W 915 nt4.07□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ADP1YCR011C 3150 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 HFA1YMR207C 6372 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PRM7YDL039C 2097 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 MLF3YNL074C 1359 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 STB2YMR053C 2553 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YDR056CYDR056C 618 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YER145C-AYER145C-A 438 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 BUD13YGL174W 801 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 NTR2YKR022C 969 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YKR104WYKR104W 921 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PAU17YLL025W 375 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 UBI4YLL039C 1146 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PEP5YMR231W 3090 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 TRM44YPL030W 1704 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RIA1YNL163C 3333 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 TGL4YKR089C 2733 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ABF1YKL112W 2196 nt4.06□□□□□ -1.76
SYF2P53277 BSC5YNR069C 1470 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RRP45YDR280W 918 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 EAF5YEL018W 840 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 SUA7YPR086W 1038 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 POP4YBR257W 840 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 RIM21YNL294C 1602 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 FLO8YER109C 2400 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PEX30YLR324W 1572 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YCR023CYCR023C 1836 nt4.05□□□□□ -1.76
SYF2P53277 KIC1YHR102W 3243 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 ERG4YGL012W 1422 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 MEF2YJL102W 2460 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 YHR177WYHR177W 1362 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 PMC1YGL006W 3522 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 snR7-SsnR7-S 179 nt4.04□□□□□ -1.76
SYF2P53277 TRM8YDL201W 861 nt4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.8 ms