Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DAP3P51398 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DAP3P51398 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DAP3P51398 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DAP3P51398 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DAP3P51398 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DAP3P51398 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DAP3P51398 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms