Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POU3F4P49335 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
POU3F4P49335 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms