Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCLCP48506 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLCP48506 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLCP48506 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCLCP48506 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCLCP48506 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLCP48506 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLCP48506 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCLCP48506 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCLCP48506 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCLCP48506 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCLCP48506 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms