Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PI4KAP42356 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PI4KAP42356 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PI4KAP42356 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms