Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPL13AP40429 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL13AP40429 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms