Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL3P39023 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL3P39023 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3P39023 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3P39023 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL3P39023 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL3P39023 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL3P39023 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL3P39023 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL3P39023 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL3P39023 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL3P39023 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPL3P39023 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms