Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TM4SF1P30408 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TM4SF1P30408 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TM4SF1P30408 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms