Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDC27P30260 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC27P30260 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC27P30260 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC27P30260 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDC27P30260 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDC27P30260 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC27P30260 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC27P30260 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC27P30260 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC27P30260 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC27P30260 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC27P30260 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC27P30260 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC27P30260 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms