Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD34P28906 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD34P28906 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD34P28906 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD34P28906 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CD34P28906 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD34P28906 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD34P28906 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD34P28906 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CD34P28906 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD34P28906 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD34P28906 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms