Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKBIAP25963 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms